In maart 2017 opende de Ombudsman dit onderzoek op eigen initiatief naar de transparantie van de besprekingen over ontwerpwetgeving in de voorbereidende instanties van de Raad van de EU. In de loop van het onderzoek stelde de Ombudsman specifieke vragen aan de Raad, startte hij een openbare raadpleging en inspecteerde hij wetgevingsdossiers van de Raad.

De Ombudsman stelde vast dat de praktijken van de Raad neerkwamen op wanbeheer. Zij bekritiseerde met name het feit dat de Raad niet systematisch de identiteit vastlegt van de lidstaten die in voorbereidende instanties standpunten innemen over ontwerpwetgeving. Zij bekritiseerde ook de wijdverbreide praktijk om de toegang tot wetgevingsdocumenten te beperken (door ze te markeren als “LIMITE”) terwijl het besluitvormingsproces aan de gang is.

In haar aanbeveling van 9 februari 2018 deed de Ombudsman drie specifieke aanbevelingen en verschillende suggesties aan de Raad over de wijze waarop de transparantie van zijn wetgevingsproces kan worden verbeterd.

De Raad heeft niet binnen de wettelijk voorgeschreven termijn van drie maanden gereageerd op de aanbevelingen van de Ombudsman. De Ombudsman sloot de zaak daarom af en bevestigde haar bevindingen, haar aanbevelingen en haar suggesties voor verbetering. Vervolgens heeft zij een "speciaal verslag" ingediend bij het Europees Parlement, waarin zij haar bevindingen onderschrijft.