L’équipe du cabinet dépend personnellement de la Médiatrice, et travaille sous son autorité directe. Elle conseille et assiste la Médiatrice, afin de veiller à la mise en œuvre de sa vision et de ses objectifs.

La direction des enquêtes, qui comprend une unité «Gestion des affaires» (voir ci-après), est responsable des activités principales du bureau, au nombre desquelles figurent la réalisation d’enquêtes sur les possibles cas de mauvaise administration par les institutions, organes et agences de l’Union européenne et la promotion des bonnes pratiques administratives.

L’unité communication est chargée d’informer le grand public, les publics cibles clés et les autres parties prenantes au sujet des enquêtes et des travaux stratégiques de la Médiatrice, ainsi que de son engagement dans les débats et les évolutions politiques pertinents de l’UE.
L’unité est responsable des travaux de communication stratégiques généraux, telle la coordination du Réseau européen des Médiateurs.