Evropska komisija je na podlagi Pogodb EU odgovorna za zagotavljanje, da vse države članice ustrezno uporabljajo zakonodajo EU. To izvaja na podlagi lastnih preiskav ali pritožb posameznikov ali pravnih oseb v zvezi s kršitvami zakonodaje EU (več informacij o postopkih ugotavljanja kršitev).

Komisija ima pri odločanju, ali in kdaj naj začne postopek ugotavljanja kršitev, široko diskrecijsko pravico. Pri obravnavanju pritožb zaradi kršitev mora upoštevati nekatera pravila (več informacij).

Državljani in pravne osebe se lahko obrnejo na varuhinjo človekovih pravic, kadar menijo, da Komisija ni ustrezno obravnavala pritožbe zaradi kršitev, npr. kadar Komisija pritožbe ni obravnavala pravočasno ali državljanov ali pravnih oseb ni obveščala o svojih korakih.

Vendar je, kadar gre za vsebinsko stališče Komisije v zvezi s pritožbo zaradi kršitev, kot je odločitev o zaključku primera brez ukrepanja, vloga varuhinje človekovih pravic omejena zaradi široke diskrecijske pravice Komisije. Varuhinja si lahko v takih primerih prizadeva zagotoviti, da Komisija ustrezno utemelji svoje stališče, vendar Komisijo k ponovni obravnavi odločbe pozove le v primeru suma na očitno napako.