Dobre zarządzanie funduszami UE jest jednym z głównych obszarów działalności Europejskiego Rzecznika Praw Obywatelskich. UE przekazuje finansowanie w formie dotacji dla projektów lub organizacji, które wspierają wspólne interesy UE lub pomagają w realizacji programu lub polityki UE. UE przeznacza również część swojego budżetu na zamówienia publiczne, wykorzystywane na usługi i materiały niezbędne do pracy instytucji europejskich lub realizacji polityki UE.

Rzecznik dopilnowuje, aby instytucje, organy i jednostki organizacyjne UE odpowiednio zarządzały programami finansowania i przetargami. Oznacza to, że mają one działać zgodnie z odpowiednimi przepisami ramowymi oraz postępować z partnerami finansującymi i wykonawcami w sposób uczciwy i według zasady dobrej administracji. Rzecznik zajmuje się sprawami dotyczącymi udzielania dotacji i zamówień, a także niektórymi aspektami realizacji umów.

Rolą Rzecznik w sprawach dotyczących udzielania zamówień jest zbadanie, czy nie wystąpił oczywisty błąd w ocenie lub błąd proceduralny. Rzecznik może sprawdzać, czy dany organ UE działał zgodnie z postanowieniami umowy, rozporządzeniem finansowym UE, innymi obowiązującymi przepisami oraz zasadą dobrej administracji. Rola Rzecznik nie polega na ponownej ocenie wniosku projektowego lub przetargu ani na pośrednictwie w sporach umownych.