Goed beheer van EU-middelen is een van de belangrijkste werkterreinen van de Europese Ombudsman. De EU verstrekt financiering in de vorm van subsidies aan projecten of organisaties die gemeenschappelijke belangen van de EU bevorderen of een EU-programma of -beleidsmaatregel helpen uitvoeren. De EU wijst een deel van haar begroting ook toe aan overheidsopdrachten voor de aankoop van diensten en materiaal die nodig zijn voor de werking van de Europese instellingen of de uitvoering van EU-beleid.

De Ombudsman heeft tot doel ervoor te zorgen dat de instellingen, organen, instanties en agentschappen van de EU financieringsprogramma’s en aanbestedingen naar behoren beheren. Dit houdt in dat zij in overeenstemming met het toepasselijke rechtskader handelen en op eerlijke wijze en in overeenstemming met de beginselen van behoorlijk bestuur met financieringspartners en contractanten omgaan. De Ombudsman behandelt zaken die betrekking hebben op de toekenning van subsidies en contracten, alsook bepaalde aspecten in verband met de uitvoering van contracten.

De rol van de Ombudsman in zaken betreffende de gunning van opdrachten bestaat erin te onderzoeken of er sprake was van een kennelijke beoordelingsfout of een procedurefout. De Ombudsman kan onderzoeken of het EU-orgaan in kwestie heeft gehandeld in overeenstemming met de wettelijke bepalingen van het contract, het Financieel Reglement van de EU en andere toepasselijke wettelijke bepalingen, alsook met de beginselen van behoorlijk bestuur. Het is niet de taak van de Ombudsman een projectvoorstel of aanbesteding opnieuw te beoordelen of te bemiddelen in contractuele geschillen.