Geras ES lėšų valdymas yra pagrindinė Europos ombudsmeno darbo sritis. ES teikia finansavimą dotacijų forma projektams ar organizacijoms, kurios prisideda prie bendrų ES interesų arba padeda įgyvendinti ES programą ar politiką. ES taip pat skiria dalį savo biudžeto viešiesiems pirkimams, kurie naudojami paslaugoms ir medžiagoms, reikalingoms Europos institucijų darbui arba ES politikai įgyvendinti.

Ombudsmenė siekia užtikrinti, kad ES institucijos, įstaigos, tarnybos ir agentūros tinkamai valdytų finansavimo programas ir viešuosius pirkimus. Tai reiškia, kad jos turi veikti laikydamosi atitinkamų teisinių nuostatų ir su finansavimo partneriais bei rangovais elgtis sąžiningai, laikantis gero administravimo principų. Ombudsmenė nagrinėja bylas, susijusias su dotacijų skyrimu ir sutartimis, taip pat tam tikrus sutarčių vykdymo aspektus.

Ombudsmenės vaidmuo bylose, susijusiose su sutarčių sudarymu, yra patikrinti, ar nebuvo akivaizdžios vertinimo ar procedūrinės klaidos. Ombudsmenė gali patikrinti, ar atitinkama ES įstaiga veikė laikydamasi sutarties teisinių nuostatų, ES finansinio reglamento ir kitų taikytinų teisinių nuostatų, taip pat gero administravimo principų. Ombudsmenės vaidmuo nėra iš naujo vertinti projekto pasiūlymą ar konkursą arba tarpininkauti sprendžiant sutartinius ginčus.