Das Kabinett ist direkt der Bürgerbeauftragten unterstellt und ihr persönlich gegenüber verantwortlich. Es berät und unterstützt die Bürgerbeauftragte, um die Umsetzung ihrer Vision, Strategie und Ziele zu gewährleisten.
Alle Kabinettsmitglieder können die Bürgerbeauftragte, wenn nötig, auf Dienstreisen begleiten und je nach Anordnung an der Ausarbeitung von Reden, Präsentationen oder Berichten mitarbeiten.

Die Direktion Untersuchungen, zu der das Referat Fallbearbeitung gehört (siehe unten), ist für die Kerntätigkeiten des Büros des Europäischen Bürgerbeauftragten zuständig, nämlich die Durchführung von Untersuchungen zu möglichen Fällen von Missständen in der Verwaltungstätigkeit der Organe, Einrichtungen und sonstigen Stellen der EU sowie die Förderung bewährter Verwaltungspraktiken.

Das Referat Kommunikation hat die Aufgabe, die Öffentlichkeit, die wichtigsten Zielgruppen und andere Akteure über die Untersuchungen und die strategische Arbeit der Bürgerbeauftragten sowie ihre Teilnahme an relevanten EU-Debatten und politischen Entwicklungen zu unterrichten.
Das Referat ist für die strategische Kommunikation und die Koordinierung des Europäischen Verbindungsnetzes der Bürgerbeauftragten zuständig.

Das Referat Personal, Verwaltung und Haushalt ist für Angelegenheiten in den folgenden Bereichen zuständig: Humanressourcen und Wohlergehen der Mitarbeiter; Betriebskontinuität und -sicherheit; Haushalt und Finanzen; die Gebäude der Einrichtung; Ausrüstung und logistische Unterstützung; Dokumentenverwaltung und Archivierung; Informations- und Kommunikationstechnologien (IKT) sowie die gesamte operative Unterstützung der Fallbearbeitung.