Europeiska ombudsmannen kan granska klagomål från personal inom EU-förvaltningen. Ombudsmannen har dock inte befogenhet att upphäva ett beslut som fattats av förvaltningen.

Innan den anställde vänder sig till ombudsmannen måste han eller hon till fullo ha utnyttjat det tillämpliga interna klagomålsförfarandet. I de flesta fall är förfarandet det som fastställs i artikel 90 i EU:s tjänsteföreskrifter.

Om någon av EU:s institutioner, organ, organisationer eller byråer inte har svarat på en anställds begäran om information, kan ombudsmannen dock föreslå att förvaltningen svarar, även om det interna klagomålsförfarandet inte har följts.

EU-förvaltningen har stort utrymme för skönsmässig bedömning när den organiserar sina personalresurser och utvärderar personalens prestationer. Ombudsmannen inleder normalt endast en undersökning av ett klagomål från personalen om det finns tecken på uppenbara fel i bedömningen eller allvarliga brister i förfarandet eller systemet.

Ombudsmannen har en formell uppgift att säkerställa att EU-förvaltningen följer bestämmelserna i konventionen om rättigheter för personer med funktionsnedsättning. Ombudsmannen har också en roll när det gäller att se till att EU-förvaltningen fullgör sina skyldigheter i fråga om förfaranden mot trakasserier.