Správne riadenie finančných prostriedkov EÚ je základnou oblasťou práce európskeho ombudsmana. EÚ poskytuje financovanie vo forme grantov určených pre projekty alebo organizácie, ktoré presadzujú záujmy EÚ alebo pomáhajú pri vykonávaní programov či politík EÚ. Popri tom EÚ prideľuje časť svojho rozpočtu na verejné obstarávanie, ktoré sa využíva na zabezpečenie služieb a materiálu potrebných na fungovanie európskych inštitúcií alebo vykonávanie politík EÚ.

Cieľom ombudsmana je zaistiť, aby inštitúcie, orgány, úrady a agentúry EÚ náležite riadili programy financovania a výzvy na predkladanie ponúk. Znamená to, že musia konať v súlade s príslušným právnym rámcom, zaobchádzať s partnermi v rámci financovania a s dodávateľmi spravodlivým spôsobom a dodržiavať pri tom zásady dobrej správy vecí verejných. Ombudsman sa zaoberá prípadmi, ktoré sa týkajú udeľovania grantov a zadávania zákaziek, ako aj niektorými aspektmi týkajúcimi sa plnenia zmlúv.

Úlohou ombudsmana v záležitostiach spojených so zadávaním zákaziek je preskúmať, či nedošlo k zjavne nesprávnemu posúdeniu alebo k procesnej chybe. Ombudsman môže preskúmať, či príslušný orgán EÚ konal v súlade s právnymi ustanoveniami zmluvy, nariadením EÚ o rozpočtových pravidlách a inými uplatniteľnými právnymi ustanoveniami, ako aj so zásadami dobrej správy vecí verejných. Úlohou ombudsmana nie je opätovne posúdiť návrh projektu alebo ponuku ani plniť funkciu sprostredkovateľa v zmluvných sporoch.