ES administracija yra nustačiusi nemažai taisyklių, kuriomis siekiama užkirsti kelią interesų konfliktams arba kitiems etikos pažeidimams. Ombudsmenės vaidmuo – padėti užtikrinti, kad šios taisyklės būtų įgyvendintos, taip pat padėti institucijoms suvokti, kad būtina paisyti etinių nuostatų.

Ypatinga ombudsmenės veiklos sritis yra „sukamųjų durų“ reiškinio klausimas, iškylantis tuomet, kai pareigūnai palieka ES administraciją ir pradeda eiti pareigas privačiajame sektoriuje (arba atvirkščiai). Į privatųjį sektorių pereinantys pareigūnai gali siekti naudotis tinklais, prie kurių jie turėjo prieigą atlikdami savo ankstesnes pareigas, arba bandyti daryti įtaką ES teisės aktams ar reglamentavimui. Tai gali pakenkti visuomenės pasitikėjimui ES administracija.

Nors interesų grupių siekis daryti įtaką ES demokratiniam sprendimų priėmimo procesui yra įprastas, labai svarbu, kad tai vyktų laikantis aukščiausių skaidrumo standartų, siekiant sumažinti susirūpinimą dėl galimų interesų konfliktų. Lobistinės veiklos skaidrumas ir tai, kaip interesų grupės bendradarbiauja su ES institucijomis, yra nuolatinės ombudsmenės tyrimų temos.

Ombudsmenė gali nagrinėti etikos klausimus, kuriuos kelia skundo pateikėjai, nepatenkinti tuo, kaip atitinkama institucija sprendė jiems rūpimus klausimus. Tačiau ji taip pat gali savo iniciatyva nagrinėti klausimus, kai sužino apie galimą visuomenės susirūpinimą ir randa tam pagrindo.