Kansliteamet rapporterar personligen till ombudsmannen och arbetar under hennes direkta ledning. Teamet har en rådgivande roll gentemot ombudsmannen och hjälper henne att säkerställa att hennes vision, strategi och mål genomförs.

Direktoratet för undersökningar, som omfattar en enhet för ärendehantering (nedan), ansvarar för ombudsmannens kärnverksamhet, nämligen att undersöka eventuella fall av administrativa missförhållanden vid EU:s institutioner, organ och byråer och främja god administrativ praxis.

Kommunikationsenheten ansvarar för att informera allmänheten, viktiga målgrupper och andra intressenter om ombudsmannens undersökningar och strategiska arbete samt om hennes engagemang i den politiska utvecklingen och relevanta EU-debatter.
Enheten sköter den allmänna strategiska kommunikationen och har en samordnande funktion för Europeiska ombudsmannanätverket.